فدراسيون ابتدا در سال 1388 در اتاق بازرگاني، صنايع، معادن و کشاورزی ‌ايران به نام «انجمن صنايع طيور ‌ايران» ثبت گردید.

از آنجايی که تعدد تشکل‌‌هاي صنفی و به دنبال آن تعدد نظرات و تحليل‌‌های ناشی از تشکل‌‌های موازی در يک موضوع يا محصول خاص در صنعت طيور همواره برای همگان چالش آفرين بوده و اساسنامه انجمن صنايع و ‌ترکيب اعضاي آن پوشش دهنده موضوع نبود، بدین ترتیب بنابر ضرورت فعاليت جدی يک تشکل بالادستی فراگير و يکپارچه در صنعت طيور ‌ايران «انجمن ملی طيور ‌ايران» مرکب از کليه تشکل‌‌های صنفی معتبر و ذيصلاح حوزه‌‌های مختلف صنعت مرغداری (طیور) ایران ‌در مجموعه کلان زنجيره ارزش از نهاده‌‌های توليد (خوراک، دارو، مکمل، کنسانتره، افزودنی ‌ها، مواد بیولوژیک و واکسن) تا توليد گوشت مرغ و تخم مرغ، صنايع خدماتی، تبديلی و مديريت بازار توزيع و عرضه محصولات طيور در داخل، صادرات و ساير امور مرتبط به عنوان پارلمان صنعت طيور ‌ايران که مسئوليت صيانت از حقوق تمامي حلقه‌ها را عهده دار است رسماً از آبان سال 1397 در اتاق بازرگانی، صنايع، معادن و کشاورزی ‌ايران در قالب تشکل بالادستی به ثبت رسيده و فعاليت نمود که در مهرماه 1400 بنا بر ارتقای جايگاه تشکلی در قالب يک تشکل ملی فراگير و بالادستی تحت عنوان «فدراسيون طيور ‌ايران» تطبيق داده شده و ادامه فعاليت مي‌دهد.